برنامج anagene لسنوات الثالثة نهائي

برنامج anagene لسنوات الثالثة نهائي

بسم الله الرحمن الرحيم
برنامج anagene لسنوات الثالثة نهائي

وصلة التحميل

http://up.media1fire.com/hltncebr8esu
 

 ou

http://dogefile.com/f7eb86owdcr0.html 

شرح طريقة عمله:
























هذا مثال تطبيقي يوضح كيف تستعمل البرنامج:

يحتوي سطح خلايا الدم الحمراء على مولدات ضد معينة موروثة تحدد مجاميع الدم التي تكون نظام يسمى نظام ABO يمتلك الإنسان 3 أليلات مشفرة لكل فصيلة دم نجد : أليل A ، أليلB ، أليل O . تركيب محددات نظام ABO يتم عبر مراحل
آخر مرحلة تتم بواسطة إنزيم مشفر من طرف مورثة تقع على الصبغي رقم 9 تتواجد عدة أليلات لهذه المورثة .
الإشكالية : من المعروف أن الاختلاف بين المحددات الثلاث يكمن في الجزء السكري ، فهل هذا يعني أن هناك تشابه في الجزء
البروتيني ؟


يمكن استعمال برنامج Anagène للإجابة عن هذه الإشكالية بإتباع الخطوات الآتية :
1- استخراج التتابعات :
اختر تعليمة Thèmes d'études/ Fichier أو بالنقر على



وافتح ملف Relation Génotype Phénotype / Phénotype groupes sanguins ABO ثم انقر على OK فتظهر النافذة الآتية :






س1- هل يوجد اختلاف بين التتابعات الثلاث ؟
ج1- للإجابة نقوم بإجراء مقارنة بين التتابعات
2- مقارنة التتابعات النيوكليوتيدية :
اختر تعليمة Sélectionner tout / Editon ( قصد اختيار التتابعات الثلاث في نفس الوقت )

ثم انقر على أيقونة

واختر Alignement avec discontinuité وانقر على OK فتظهر النافذة التالية :






قم بتحريك السلم لمعرفة الاختلاف بين التتابعات واستعمل المؤشر المتطاول بالنقر على لتحديد موضع الاختلاف بدقة على السلم

س2- ماذا تلاحظ ؟
ج2- يوجد اختلاف بين التتابعات فنجد :
-أليل B تغير في 4 نيوكليوتيدات في المواقع 523 ، 700 ،793 ، 800 على التوالي



-أليل O حدوث حذف لنيوكليوتيدة في الموقع 258


التغير الحاصل في تتابعات ADN يستلزم وجود تغير في البروتين
س3- ما هو عدد الأحماض الأمينية في السلاسل الببتيدية للثلاث أليلات B A و O ؟
ج3-أ- التوقعات الحسابية لعدد الأحماض الأمينية في كل سلسلة ببتيدية :
للتحصل على عدد النيوكليوتيدات في كل تتابع نقوم بتحريك السلم أو بالنقر على بعد تحديد التتابع المطلوب

- كم يلزم من حمض أميني لتكوين السلسلة الببتيدية للأليل
1062 / 3 = 354 - 1 ( كودون التوقف ) = 353 حمض أميني
-كم يلزم من حمض أميني لتكوين السلسلة الببتيدية للأليل B
1062 / 3 = 354 - 1 = 353 حمض أميني
- كم يلزم من حمض أميني لتكوين السلسلة الببتيدية للأليل O
1061 / 3 = 353 - 1 = 352 حمض أميني
ب- معطيات البرنامج :
للتحصل على السلاسل الببتيدية من البرنامج يجب اجراء تحويل للتتابعات النيوكليوتيدية
3- تحويل التتابعات :
حدد التتابعات الثلاث O , B ,A باستعمال تعليمة Sélectionner tout / Edition
اختر تعليمة Convertir les séquences / Traiter أو بالنقر مباشرة على



فتظهر النافذة

ملاحظة : يجب وضع نافذة التتابعات الببتيدية جنب نافذة التتابعات النيوكليوتيدية
وهذا للتمكن من تنفيذ أمر آخر على التتابعات لأن برنامج Anagène لا ينفذ أمرا ما إذا
كانت أكثر من نافذة مفتوحة لذلك نقومبالتأشير كما هو واضح في الصورة
ثم انقر على OK فتظهر نافذة التتابعات النيوكليوتيدية جنب نافذة التتابعات الببتيدية كما هو موضح فيما يلي :

يمكن معرفة عدد الأحماض الأمينية في التتابعات بتحريك السلم أو النقر مباشرة على بعد تحديد التتابعات المطلوبة

ملاحظة : عند تحويل التتابعات إلى ببتيدية يجب تغيير سلم القراءة الى ثلاثيات بالنقر عليه .

س4- هل تتوافق التوقعات الحسابية مع معطيات البرنامج ؟

ج4- جدول1 : مقارنة بين التوقعات الحسابية ومعطيات Anagéne

التتابعات الببتيدية	التوقعات الحسابية	معطيات Anagéne	الملاحظات
A	353	353	توافق النتائج
B	353	353	توافق النتائج
O	352	116	اختلاف النتائج

س5- فسر النتائج ؟

ج5- لتفسير النتائج نقوم بإجراء مقارنة بسيطة بين التتابعات الببتيدية باختيار تعليمة Comparer les séquences / Traiter أو بالنقر مباشرة على



بعد تحديد التتابعات Pro-Alléle O ، Pro-Alléle B ، Pro-Alléle A بالتتابع فتظهر النافذة التالية :

نقوم بتحريك النافذة فنلاحظ ما يلي

- السلسلة الببتيدية A تحتوي 353 حمض أميني بعد ظهور شفرة التوقف

- السلسلة الببتيدية B تحتوي 353 حمض أميني بعد ظهور كودون توقف لكن تختلف عن سلسلة A في 4 أحماض أمينية

- السلسلة الببتيدية O تحتوي 116 حمض أميني بعد ظهور كودون توقف

جدول 2 : الاختلافات بين الأليلات O ،B ،A على مستوى تتابع ADN والسلسلة الببتيدية





س6- ماذا تلاحظ ؟ ج6- من خلال الجدول نلاحظ :

التتابعين Bو A متماثلين من حيث طول السلسلة الببتيدية لكن يختلف أليل B في 4 نيوكليوتيدات وبالتالي ظهور 4 اختلافات على مستوى تتابع الأحماض الأمينية للسلسلة الببتيدية

أما أليل O فهو مختلف عن B و A لحدوث حذف لنيوكليوتيدة في الموقع 258 مما أدى إلى خلل في إطار القراءة و ظهور كودون توقف فجأة في الموقع 117 للسلسلة الببتيدية وبالتالي يتكون متعدد ببتيد أقصر

ملاحظة :

طفرات الاستبدال لا تؤدي إلى تغير كبير فطول التتابع يبقى نفسه وقد لا تؤدي إلى ظهور تغير في البروتين بعكس طفرتي

الحذف والإضافة التي تؤدي إلى تغيرات واضحة لأنها تحدث تغير في إطار القراءة

خلاصــة

محددات نظام ABO لاتختلف فقط في الجزء السكري و انما تختلف أيضا في الجزء البروتيني فهي ناتجة عن ثلاث أليلات مختلفة تحتل نفس المكان في الصبغي الا أن تتابع النيوكليوتيدات

مختلف وبالتالي ظهور متعدد بروتين مختلف وهذا يستلزم ظهور صفة جديدة ، غير أن الإختلاف في

الجزء البروتيني لا يؤثر مناعيا .